RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 MYOD1P15172 320 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 C15orf61A6NNL5 157 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TCF24Q7RTU0 167 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 ENY2Q9NPA8 101 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 MPV17P39210 176 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 RTL8BQ17RB0 113 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 MORN5Q5VZ52 161 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 AP1S3Q96PC3 154 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 GNG12Q9UBI6 72 aa13.67□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 MGAQ8IWI9 3026 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 C8orf88P0DMB2 117 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SEC11AP67812 179 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 HBBP68871 147 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 PET117Q6UWS5 81 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SPINT2O43291 252 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TNFRSF14Q92956 283 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 S1PR3Q99500 378 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 CEP250Q9BV73 2442 aa13.66□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 H3BUT2 72 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 COX8AP10176 69 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 LGALS7P47929 136 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 ZNF138P52744 262 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 RBPJQ06330 500 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 EDDM3AQ14507 147 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 TMEM186Q96B77 213 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 OBP2BQ9NPH6 170 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 CACNA1GO43497 2377 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 LIPFP07098 398 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 C15orf65H3BRN8 121 aa13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
GDE1-201ENST00000353258 C9orf118A6NHY6 69 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 K7EP34 96 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 PEX7O00628 323 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 ADH4P08319 380 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 FTH1P19P0C7X4 201 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 ZNF137PP52743 207 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 OR9G1Q8NH87 305 aa13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 GNG7O60262 68 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 PYYP10082 97 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 C9orf106Q8NAJ2 232 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 LRRC29Q8WV35 223 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 SGK494Q96LW2 274 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 C7orf69Q9H7B7 122 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 TNCP24821 2201 aa13.63□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 MLANAQ16655 118 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 HILPDAQ9Y5L2 63 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 FNDC10F2Z333 226 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 OR5AL1P0C617 328 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 FABP6P51161 128 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 GNG5P63218 68 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 LINC01545Q5VT33 79 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 ACP7Q6ZNF0 438 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZT83 130 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 ZNF329Q86UD4 541 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 OR2K2Q8NGT1 345 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 OR10AG1Q8NH19 301 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 HSPB8Q9UJY1 196 aa13.62□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 H3BRM9 83 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 HOXC12P31275 282 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 ZNF134P52741 427 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 TEX45Q8NA69 505 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 PPIAL4GP0DN37 164 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 DEFB109BQ30KR1 87 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 S100A7AQ86SG5 101 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 SPTBN2O15020 2390 aa13.61□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 A0A0G2JLM5 398 aa13.6□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.6□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 GTSF1Q8WW33 167 aa13.6□□□□□ -0.23
GDE1-201ENST00000353258 A6NDN8 102 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms