RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 FBXL15Q9H469 300 aa12.74□□□□□ -0.37
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PTPRU-201ENST00000345512 GAFA1Q96PS6 74 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRU-201ENST00000345512 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRU-201ENST00000345512 PDLIM4P50479 330 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRU-201ENST00000345512 ECSCRQ19T08 205 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRU-201ENST00000345512 NEUROG1Q92886 237 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRU-201ENST00000345512 TNCP24821 2201 aa12.67□□□□□ -0.38
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