RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 COQ2Q96H96 371 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 WFDC1Q9HC57 220 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CCL20P78556 96 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CA1P00915 261 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1D-12P01611 117 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 WNK3Q9BYP7 1800 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 BTCP35070 178 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 WDR90Q96KV7 1748 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 GZMBP10144 247 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 TRGV11A0A075B6L2 103 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 C15orf32Q32M92 178 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0G2JNJ9 132 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 EFNA4P52798 201 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 Q9UFV3 132 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 TIMP3P35625 211 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 NPIPB5A8MRT5 1133 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV2A0A0B4J234 112 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa18.48■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CRYGSP22914 178 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 NDPQ00604 133 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV1-8P0DP01 117 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 ICE1Q9Y2F5 2266 aa18.47■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CYB5R2Q6BCY4 276 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 GFI1Q99684 422 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CD177Q8N6Q3 437 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A20O43772 301 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 NRN1Q9NPD7 142 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 TET1Q8NFU7 2136 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 DSCR9P59020 149 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 OR5A1Q8NGJ0 315 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM178BH3BS89 294 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 ATRAIDQ6UW56 229 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 OCC1Q8TAD7 63 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WWC5 75 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 SPCS1Q9Y6A9 102 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 NAPSAO96009 420 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV3-53P01767 116 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 NPC2P61916 151 aa18.45■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 DOCK4Q8N1I0 1966 aa18.45■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BUX3 64 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 C5orf24Q7Z6I8 188 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 PMS2P5A8MQ11 134 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 SCRT1Q9BWW7 348 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 MST1P26927 711 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 PAX2Q02962 417 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 FAM89BQ8N5H3 189 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 CYSLTR1Q9Y271 337 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 OVOL1O14753 267 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 LY6G6FQ5SQ64 297 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 SIPA1L1O43166 1804 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 LOC285556D6RIA3 1793 aa18.43■□□□□ 0.54
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM166AQ6J272 317 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 RNF182Q8N6D2 247 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 LY6HO94772 140 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 RCHY1Q96PM5 261 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 H0YIZ8 118 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 J3QRE1 110 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 FAM169BQ8N8A8 192 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 TRAV3A0A0B4J244 114 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 HBDP02042 147 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF688P0C7X2 276 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF14Q92956 283 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 PSPNO60542 156 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 LILRA1O75019 489 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A15Q9Y619 301 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 H3BUT2 72 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 ACTL10Q5JWF8 245 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 DPM2O94777 84 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 SRRM5B3KS81 715 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 IL18BPO95998 194 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 DTX2Q86UW9 622 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GV72 72 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRE2 83 aa18.41■□□□□ 0.54
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