RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 PRSS46E5RG02 174 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 IGHV3-13P01766 116 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 IGHV3-7P01780 117 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 SP1P08047 785 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 HSD52Q0P140 79 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 ENY2Q9NPA8 101 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 BSNQ9UPA5 3926 aa14.86□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 REG1BP48304 166 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 ZNF146Q15072 292 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 SSX8Q7RTT4 187 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 JKAMPQ9P055 326 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 TCF19Q9Y242 345 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.85□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 UQCRFS1P47985 274 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 C12orf49Q9H741 205 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 HIGD1CA8MV81 97 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 H3BUT2 72 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 CD24P25063 80 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 RASL11AQ6T310 242 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 HCFC1P51610 2035 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 WNT9BO14905 357 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 ERVK11-1P61568 191 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.84□□□□□ -0.03
PKP3-201ENST00000331563 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TMEM140Q9NV12 185 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 RELNP78509 3460 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 HTR1DP28221 377 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TAS2R45P59539 299 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 OR5A1Q8NGJ0 315 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 C1RLQ9NZP8 487 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 GNG12Q9UBI6 72 aa14.83□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 H3BRM9 83 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PRR20EP86478 221 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PRR20CP86479 221 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PRR20DP86480 221 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PRR20BP86481 221 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PRR20AP86496 221 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PRSS33Q8NF86 280 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 MDS2Q8NDY4 140 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.82□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 F2RL2O00254 374 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 EDDM3AQ14507 147 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZNF503Q96F45 646 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZNF766Q5HY98 468 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 Q8TCH9 128 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.81□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 SPINT2O43291 252 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 COQ2Q96H96 371 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 S1PR3Q99500 378 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZZEF1O43149 2961 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PSMB11A5LHX3 300 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 MOB3BQ86TA1 216 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 PERPQ96FX8 193 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.8□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 A0A0G2JLM5 398 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 SPRR3Q9UBC9 169 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 OR2J3O76001 311 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.79□□□□□ -0.04
PKP3-201ENST00000331563 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms