RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC160A6NGH7 325 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 OR4C46A6NHA9 309 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 NCR3O14931 201 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 LYZL6O75951 148 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 AHSA1O95433 338 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 TTRP02766 147 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 IFNA16P05015 189 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 SERPINA6P08185 405 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 OR4E1P0C645 316 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 OMPP47874 163 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 DEFA1P59665 94 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 CNBPP62633 177 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 C1orf137Q5JT78 98 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM86BQ8N661 226 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 C3orf56Q8N813 242 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 DDI1Q8WTU0 396 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 BORCS7Q96B45 105 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 C2orf50Q96LR7 162 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 TSPAN32Q96QS1 320 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM70Q9BUB7 260 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 DCSTAMPQ9H295 470 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 C14orf132Q9NPU4 83 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 ALPK3Q96L96 1907 aa0.34□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 KIF1BO60333 1816 aa0.34□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 SCN8AQ9UQD0 1980 aa0.34□□□□□ -2.35
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PPIBP23284 216 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CEBPGP53567 150 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RHOBP62745 196 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ESRGQ1W209 222 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CDKL4Q5MAI5 379 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 BRMS1LQ5PSV4 323 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 GKN2Q86XP6 184 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SBSPONQ8IVN8 264 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00301Q8NCQ3 95 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR2T10Q8NGZ9 312 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM254Q8TBM7 123 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM14CQ9P0S9 112 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PKIGQ9Y2B9 76 aa0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 E9PCH4 1651 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 MED12Q93074 2177 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PTPRFP10586 1907 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CHP2O43745 196 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RPS20P60866 119 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TSNQ15631 228 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 IMPG1Q17R60 797 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LINC01554Q52M75 96 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C2orf82Q6UX34 121 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LCA10Q71F78 164 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 Q8N6K4 173 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 GDPD1Q8N9F7 314 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR52R1Q8NGF1 315 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR8D4Q8NGM9 314 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CT55Q8WUE5 264 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 FAM172AQ8WUF8 416 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC42Q96M95 316 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 HIST1H2BLQ99880 126 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 TRIM4Q9C037 500 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR51V1Q9H2C8 321 aa0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 V9GYY5 206 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RTL1A6NKG5 1358 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 SIP14410 1827 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CLDN24A6NM45 220 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 A8MT66 165 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 CYB5BO43169 146 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 OR2J2O76002 312 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 RPP14O95059 124 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 DNAL4O96015 105 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 C8GP07360 202 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 PSG9Q00887 426 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 EDDM3AQ14507 147 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LYRM7Q5U5X0 104 aa0.32□□□□□ -2.36
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms