RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIAL4FP0DN26 164 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 AREGP15514 252 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CTAG1AP78358 180 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PRCDQ00LT1 54 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 COX19Q49B96 90 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf83Q53S99 150 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PQLC2Q6ZP29 291 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PNKDQ8N490 385 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf31Q8N9H6 132 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL13Q99616 98 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MGST2Q99735 147 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HINT2Q9BX68 163 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MIOXQ9UGB7 285 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 COL7A1Q02388 2944 aa5.67□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TENM3Q9P273 2699 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPQ1 181 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 B9A039 149 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS46E5RG02 174 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DVL1O14640 695 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RRHO14718 337 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PROP1O75360 226 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 CA2P00918 260 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GCHFRP30047 84 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF134P52741 427 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL31P62899 125 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM177Q53S58 311 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MIC13Q5XKP0 118 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PDPNQ86YL7 162 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00311Q8N616 119 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 FRZBQ92765 325 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF714Q96N38 554 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 DYNLRB1Q9NP97 96 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 C9JCJ5 164 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TSTD3H0UI37 97 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC31A2O15432 143 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB4O95168 129 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PRTN3P24158 256 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 MC5RP33032 325 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG10P50151 68 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2G2P60604 165 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 GNB1P62873 340 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 EFNB3Q15768 340 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 STPG3Q8N7X2 389 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF383Q8NA42 475 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1P1Q8NH06 330 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4X1Q8NH49 305 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf52Q96A22 123 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM18Q96B42 140 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 SFRP2Q96HF1 295 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 HARBI1Q96MB7 349 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 FUT9Q9Y231 359 aa5.65□□□□□ -1.5
SMARCE1-201ENST00000264640 PLXNB1O43157 2135 aa5.65□□□□□ -1.51
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