RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1D-12P01611 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 FOXC2Q99958 501 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 WFDC1Q9HC57 220 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ERVK11-1P61568 191 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00614P0C842 121 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TIMM23O14925 209 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM50AO95807 157 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 CGB1A6NKQ9 187 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF415Q09FC8 603 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 HSD52Q0P140 79 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 Q0VFX4 171 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 TMEM262E9PQX1 116 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 CD177Q8N6Q3 437 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM160Q9NX00 188 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 H0YIZ8 118 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 H3BUA1 57 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ADMP35318 185 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 NBL1P41271 181 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 LAGE3Q14657 143 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TTC32Q5I0X7 151 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PLXNA2O75051 1894 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 NRN1Q9NPD7 142 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGKCP01834 107 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 RFNGQ9Y644 331 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 PLNP26678 52 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF688P0C7X2 276 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 PSG3Q16557 428 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TGFAP01135 160 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF138P52744 262 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 M0R381 172 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 SLC25A20O43772 301 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 SLC17A3O00476 420 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PRTN3P24158 256 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 GPHA2Q96T91 129 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 MGST2Q99735 147 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM238C9JI98 176 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TCRAP04437 139 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0G2JNJ9 132 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 Q9UFV3 132 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 C1QTNF9P0C862 333 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 CD7P09564 240 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2E1P51965 193 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 SERF1AO75920 110 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-5P01602 117 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 RNF224P0DH78 156 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 OCC1Q8TAD7 63 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TNFSF13O75888 250 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 RASL10AQ92737 203 aa7.4□□□□□ -1.22
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