RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 TGOLN2O43493 480 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 PDE6DO43924 150 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 MYOD1P15172 320 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 ZNF137PP52743 207 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 LGALS4P56470 323 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 TCEAL7Q9BRU2 100 aa15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 ZFHX3Q15911 3703 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 LY6LH3BQJ8 138 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 CXorf1O96002 111 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 STAG3L2P0CL84 134 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 STAG3L3P0CL85 134 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 B2MP61769 119 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 KRTAP1-1Q07627 177 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 OR5B3Q8NH48 314 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 DPM3Q9P2X0 92 aa15.96■□□□□ 0.15
CLN8-208ENST00000635751 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 VENTXO95231 258 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 IGHV1-69P01742 117 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SSX3Q99909 188 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TXNDC17Q9BRA2 123 aa15.96■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 H0YJW9 148 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 NPFFO15130 113 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SMIM6P0DI80 62 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 ARL14EPLP0DKL9 152 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 BRD3OSQ6XYD6 125 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HARBI1Q96MB7 349 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.95■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 F6UZH7 168 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 S100A9P06702 114 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SAA4P35542 130 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 UBE2G2P60604 165 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TMEM177Q53S58 311 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 CST9LP1Q5W188 147 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SPNS3Q6ZMD2 512 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 STPG3Q8N7X2 389 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 RPEQ96AT9 228 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 CD5LO43866 347 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 CEACAM3P40198 252 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 RHOBP62745 196 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SSX2Q16385 188 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 C2orf83Q53S99 150 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 NANPQ8TBE9 248 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.94■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 AJUBAQ96IF1 538 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 NABP2Q9BQ15 211 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 H7BYZ3 331 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TRGC2P03986 189 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 NPPCP23582 126 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 ATP5G3P48201 142 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PDPNQ86YL7 162 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 OR5B12Q96R08 314 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SMR3AQ99954 134 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HOXA5P20719 270 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 S100PP25815 95 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 GNB1P62873 340 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PRR20EP86478 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PRR20CP86479 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PRR20DP86480 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PRR20BP86481 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 PRR20AP86496 221 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 TMEM144Q7Z5S9 345 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 OR4A5Q8NH83 315 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST1H2BKO60814 126 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST1H2BJP06899 126 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST1H2BOP23527 126 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST1H2BBP33778 126 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 NDUFA6P56556 154 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST1H2BDP58876 126 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST1H2BCP62807 126 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN8-208ENST00000635751 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms