RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMCO1	Q147U7	214 aa		12.48	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	AARD	Q4LEZ3	155 aa		12.48	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		12.48	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	RCHY1	Q96PM5	261 aa		12.48	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		12.47	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		12.47	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		12.47	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.47	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	GINS3	Q9BRX5	216 aa		12.47	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM50A	O95807	157 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMI1	P35226	326 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAK1	Q16611	211 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.46	□□□□□ -0.41
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1B0GU03	582 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFNA10	P01566	189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFRSF9	Q07011	255 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	HAGH	Q16775	308 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	BSX	Q3C1V8	233 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		12.45	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSPAN4	O14817	238 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLN5	O75503	358 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFT2D2	O95562	160 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPY1R	P25929	384 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLANA	Q16655	118 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	NMS	Q5H8A3	153 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10C1	Q96KK4	312 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035		U3KQ87	197 aa		12.44	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR4C46	A6NHA9	309 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A4	P12235	298 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBKS	Q9H477	322 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.43	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHEK1	O14757	476 aa		12.42	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAFAH1B2	P68402	229 aa		12.42	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.42	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	MED6	O75586	246 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	NDUFB6	O95139	128 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFNA4	P05014	189 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD5	P06127	495 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXB5	P09067	269 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPPC	P23582	126 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RND2	P52198	227 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF2	Q99496	336 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		12.41	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PS18	150 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A6	P12236	298 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL7	P13232	177 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035		Q8WTZ3	238 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	METTL26	Q96S19	204 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		12.4	□□□□□ -0.42
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.39	□□□□□ -0.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR10J1	P30954	320 aa		12.39	□□□□□ -0.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	TFPI2	P48307	235 aa		12.39	□□□□□ -0.43
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB11A	P62491	216 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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