RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620410.1

PTPRT-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 940 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-212ENST00000620410 GALNT14Q96FL9 552 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 CDS2O95674 445 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 IFNA17P01571 189 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 TBPP20226 339 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 AKR1C2P52895 323 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 AARDQ4LEZ3 155 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 STPG3Q8N7X2 389 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 AP3S1Q92572 193 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 CSTL1Q9H114 145 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 GABARAPH6UMI1 98 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 IGKV1-17P01599 117 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 OR5AC1P0C628 307 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 SNCAP37840 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 NPBWR1P48145 328 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 TAS2R19P59542 299 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PRR20EP86478 221 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PRR20CP86479 221 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PRR20DP86480 221 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PRR20BP86481 221 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PRR20AP86496 221 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 TRIM16LQ309B1 348 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 ZNF600Q6ZNG1 722 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 SLC35G3Q8N808 338 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 GPR146Q96CH1 333 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 COPZ2Q9P299 210 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 GPR132Q9UNW8 380 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-212ENST00000620410 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CLN5O75503 358 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 MEF2DQ14814 521 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 OR4X1Q8NH49 305 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 SOSTQ9BQB4 213 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 PRR13Q9NZ81 148 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 MPTX1A8MV57 137 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 RGS5O15539 181 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 NXPH3O95157 252 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CRYBB3P26998 211 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DEFB131AP59861 70 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 SPCS3P61009 180 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TIGITQ495A1 244 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 LEMD1Q68G75 181 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 GPR141Q7Z602 305 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 OR52E5Q8NH55 327 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM230Q96A57 120 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 GINS3Q9BRX5 216 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 NAA60Q9H7X0 242 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 U3KQE9 123 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DNAH2Q9P225 4427 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CTDSPLO15194 276 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 ATG12O94817 140 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 NPPCP23582 126 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM187Q14656 261 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 RARRES2Q99969 163 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 CACNG5Q9UF02 275 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 K7EQG2 157 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 DEFB4AO15263 64 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 B3GALNT1O75752 331 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 AKAIN1P0CW23 69 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-212ENST00000620410 OPRK1P41145 380 aa8.3□□□□□ -1.08
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