RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589641.1

RFX2-213, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 3

Gene RFX2, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-213	ENST00000589641	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF266	Q14584	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	NF1	P21359	2839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641		G3V318	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CLDN34	H7C241	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641		I3L2K1	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	MPDU1	O75352	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	BRI3	O95415	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IFNA7	P01567	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IFNA5	P01569	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	GAMT	Q14353	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR5T1	Q8NG75	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641		K7EIM0	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	AP4M1	O00189	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SOX15	O60248	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TSPAN9	O75954	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	MT-CO2	P00403	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PRH1	P02810	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SRD5A1	P18405	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SULT1A2	P50226	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	RUNX1	Q01196	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	CFHR3	Q02985	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641		Q8N2B8	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	MGST2	Q99735	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFX2-213	ENST00000589641	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641		H3BUA1	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	AGPAT2	O15120	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	NDUFB8	O95169	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	DEFA4	P12838	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	FGF7	P21781	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RFX2-213	ENST00000589641	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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