RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 OR4C46A6NHA9 309 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 HTR2BP41595 481 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 AP3S2P59780 193 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 PYDC2Q56P42 97 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 DEDD2Q8WXF8 326 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM63Q969Q1 353 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 GINS3Q9BRX5 216 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 RETNQ9HD89 108 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 V9GYH0 126 aa15.04■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 CLN5O75503 358 aa15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 AKR1C4P17516 323 aa15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 TOMM5Q8N4H5 51 aa15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 OR4X1Q8NH49 305 aa15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 RNF2Q99496 336 aa15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 CD5P06127 495 aa15.02■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 OPRK1P41145 380 aa15.02■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF79Q15937 498 aa15.02■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 MLANAQ16655 118 aa15.02■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 C2orf83Q53S99 150 aa15.02■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC190Q86UF4 302 aa15.02■□□□□ -0
GIPC1-211ENST00000589631 A0A0B4J2A0 478 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 ANXA3P12429 323 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 BMI1P35226 326 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SRPXP78539 464 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 NMSQ5H8A3 153 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 FAM90A2PQ658T7 463 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SCGB2A1O75556 95 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 CCR6P51684 374 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 LGI3Q8N145 548 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 VSIRQ9H7M9 311 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 PRR13Q9NZ81 148 aa15□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 A0A1B0GU03 582 aa14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SMCO1Q147U7 214 aa14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 NOXA1Q86UR1 476 aa14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.98□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A4P12235 298 aa14.98□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 APOC4P55056 127 aa14.98□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 IL17DQ8TAD2 202 aa14.98□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.98□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 IGKV1-17P01599 117 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 NPPCP23582 126 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 PAFAH1B2P68402 229 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TNFRSF9Q07011 255 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 ZFAND6Q6FIF0 208 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 ST8SIA2Q92186 375 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.97□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 UBE2CO00762 179 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 NPY1RP25929 384 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 Q6ZWC4 215 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TCF24Q7RTU0 167 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 LILRB2Q8N423 598 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 U3KQ87 197 aa14.96□□□□□ -0.01
GIPC1-211ENST00000589631 A0A1W2PS18 150 aa14.95□□□□□ -0.02
GIPC1-211ENST00000589631 NXPH3O95157 252 aa14.95□□□□□ -0.02
GIPC1-211ENST00000589631 LRTM2Q8N967 370 aa14.95□□□□□ -0.02
GIPC1-211ENST00000589631 SRRQ9GZT4 340 aa14.95□□□□□ -0.02
GIPC1-211ENST00000589631 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms