RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CLN5O75503 358 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRX1P54821 245 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 MIC13Q5XKP0 118 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01356Q8N9X3 169 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 PARLQ9H300 379 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 DOK5Q9P104 306 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf94C9JXX5 98 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 Q8WTZ3 238 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 ANAPC16Q96DE5 110 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC45A2Q9UMX9 530 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.862e-6■■■□□ 18.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 HINT2Q9BX68 163 aa20.44■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 S100A8P05109 93 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 CD69Q07108 199 aa20.43■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa20.43■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 TEX45Q8NA69 505 aa20.43■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 SSX3Q99909 188 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 MIOXQ9UGB7 285 aa20.43■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 C2CD4CQ8TF44 421 aa20.42■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNRD1Q9P1U0 126 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV2-23P01705 113 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVFRD-1P60508 538 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 AP4M1O00189 453 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV1-47P01700 117 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00869P0C866 280 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS10P46783 165 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCF2Q8IXL9 164 aa20.41■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 PYGO2Q9BRQ0 406 aa20.41■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CAPNS1-204ENST00000587718 BTF3L4Q96K17 158 aa20.4■□□□□ 0.86
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CAPNS1-204ENST00000587718 ADIRFQ15847 76 aa20.39■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PVRIGQ6DKI7 326 aa20.39■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 GATAD1Q8WUU5 269 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM210BQ96KR6 192 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa20.38■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 CXCL1P09341 107 aa20.38■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 GAMTQ14353 236 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF674Q2M3X9 581 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 MMD2Q8IY49 270 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 SSMEM1Q8WWF3 244 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf52Q96A22 123 aa20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT9Q9Y231 359 aa20.38■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R45P59539 299 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A13Q7RTY0 426 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF114Q8NC26 417 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMD4Q96H15 378 aa20.37■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 H7BYZ3 331 aa20.36■□□□□ 0.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 AKR1D1P51857 326 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF343Q6P1L6 599 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PQLC2Q6ZP29 291 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5B12Q96R08 314 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 IMMP2LQ96T52 175 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 LY96Q9Y6Y9 160 aa20.36■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 REG1BP48304 166 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 COMPP49747 757 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 GNB1P62873 340 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ETFRF1Q6IPR1 90 aa20.35■□□□□ 0.85
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4P4Q8NGL7 312 aa20.35■□□□□ 0.85
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