RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF114Q8NC26 417 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 PRRT1Q99946 306 aa7.25□□□□□ -1.25
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TOP3A-211ENST00000581536 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.25□□□□□ -1.25
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TOP3A-211ENST00000581536 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM50AO95807 157 aa7.24□□□□□ -1.25
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TOP3A-211ENST00000581536 LILRB2Q8N423 598 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SLC35G3Q8N808 338 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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TOP3A-211ENST00000581536 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 CACNG5Q9UF02 275 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SMPXQ9UHP9 88 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 AGRNO00468 2067 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TENM2Q9NT68 2774 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 K7EMT4 169 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 CHEK1O14757 476 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 GNG7O60262 68 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 ATG12O94817 140 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 YIF1AO95070 293 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SPCS3P61009 180 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TRIM63Q969Q1 353 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 MARC2Q969Z3 335 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 RNF2Q99496 336 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TXN2Q99757 166 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV25A0A0B4J276 109 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 A0A1B0GU03 582 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 C15orf62A8K5M9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 B3GALNT1O75752 331 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 S100A5P33763 92 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 BAK1Q16611 211 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 BSXQ3C1V8 233 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 AARDQ4LEZ3 155 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 MUC7Q8TAX7 377 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 GALNT14Q96FL9 552 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 OR10C1Q96KK4 312 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 ATP6V0BQ99437 205 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 SPATA25Q9BR10 227 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 ENY2Q9NPA8 101 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 X6R8D5 127 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TSPAN4O14817 238 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TFPI2P48307 235 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 CASC10Q5T4H9 136 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 TMED4Q7Z7H5 227 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 FAM219AQ8IW50 185 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-211ENST00000581536 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.21□□□□□ -1.26
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