RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 RCN3Q96D15 328 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 AMELYQ99218 206 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 S100A13Q99584 98 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CMTM6Q9NX76 183 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 FAM223BA6NKX1 122 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS9O00182 355 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFA3O95167 84 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ISG15P05161 165 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GLAP06280 429 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CDKN1BP46527 198 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 TMED1Q13445 227 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 RSU1Q15404 277 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 MPV17LQ2QL34 196 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS9BQ3B8N2 356 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 Q6P435 159 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB125Q8N687 156 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 TLCD1Q96CP7 247 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 NABP2Q9BQ15 211 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 TMBIM4Q9HC24 238 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 SAR1AQ9NR31 198 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CLN6Q9NWW5 311 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GTI1 187 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 METTL15A6NJ78 407 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 NME4O00746 187 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 DHFRP00374 187 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IFNA21P01568 189 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IFNA17P01571 189 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-11P01762 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 PSKH1P11801 424 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CXCR4P61073 352 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LYZP61626 148 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GINS1Q14691 196 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 SSX1Q16384 188 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LTC4SQ16873 150 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IL34Q6ZMJ4 242 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GID4Q8IVV7 300 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LFNGQ8NES3 379 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 NEK7Q8TDX7 302 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GPX8Q8TED1 209 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GALMQ96C23 342 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GALNT14Q96FL9 552 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 RDH12Q96NR8 316 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 RETNQ9HD89 108 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 JPT1Q9UK76 154 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GVY2 172 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 LYRM9A8MSI8 78 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IGLL5B9A064 214 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 H7C2Y5 167 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 AIPO00170 330 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GNGT2O14610 69 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CYB5BO43169 146 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 SULT1B1O43704 296 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 YPEL1O60688 119 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 SOX14O95416 240 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 FADS2O95864 444 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 INSP01308 110 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-7P01780 117 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 CD5P06127 495 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 COX4I1P13073 169 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 MGMTP16455 207 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 SSTR5P35346 364 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRM-208ENST00000578600 PSME3P61289 254 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms