RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 GP1BBP13224 206 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 CCL1P22362 96 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PTGDSP41222 190 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ASIPP42127 132 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 KLK7P49862 253 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 MTPNP58546 118 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C1QTNF8P60827 252 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 RPS18P62269 152 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF85Q03923 595 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5G2Q06055 141 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 PMCHL1Q16048 86 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM30BQ3MIR4 351 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 Q56UQ5 140 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 CENPWQ5EE01 88 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A30Q5SVS4 291 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.41□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 LINC01465Q8N7H1 131 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF4L2Q8NA75 395 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF114Q8NC26 417 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OR51H1Q8NH63 302 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 NEURL3Q96EH8 262 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C4orf45Q96LM5 186 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 METTL26Q96S19 204 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 IMUPQ9GZP8 106 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 AICDAQ9GZX7 198 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35B3Q9H1N7 401 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SIX2Q9NPC8 291 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PXMP4Q9Y6I8 212 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LTBP4Q8N2S1 1624 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 LAMB1P07942 1786 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 SHPRHQ149N8 1683 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-204ENST00000577468 HELZP42694 1942 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 RICTORQ6R327 1708 aa2.4□□□□□ -2.02
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PTPRM-204ENST00000577468 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa2.4□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GXF2 115 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TLCD2A6NGC4 264 aa2.4□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 LINC01619G3V211 115 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 H3BP45 60 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD6O75340 191 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PITX3O75364 302 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV3-20P01619 116 aa2.4□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 RPS4Y2Q8TD47 263 aa2.4□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 BRK1Q8WUW1 75 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 COPS9Q8WXC6 57 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS27Q9BQR3 290 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SPRY4Q9C004 299 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FXYD6Q9H0Q3 95 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB127Q9H1M4 99 aa2.4□□□□□ -2.03
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