RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSM6Q6P461 480 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPHB5Q86YW7 130 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC14L6B5MCN3 397 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 GOSR2O14653 212 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSNA1O43805 119 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SSSCA1O60232 199 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBPP02686 304 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPBWR1P48145 328 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf62A8K5M9 175 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNA4P05014 189 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB11AP62491 216 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf66Q5T8R8 295 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETFRF1Q6IPR1 90 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR9G4Q8NGQ1 327 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB40CQ96S21 281 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNG7O60262 68 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTSGP08311 255 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 MLANAQ16655 118 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRDL1Q9BU40 450 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A4P12235 298 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 OXA1LQ15070 435 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM106AQ4KMX7 169 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPANXN5Q5MJ07 72 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM8Q96KF7 97 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALG5Q9Y673 324 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADMP35318 185 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL15RAQ13261 267 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4X1Q8NH49 305 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOVL1Q9BW60 279 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSENENQ9NZ42 101 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BP45 60 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 LGALS9O00182 355 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 INSL3P51460 131 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD69Q07108 199 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C12Q96R67 309 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEMTQ9UBM1 199 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 WIPF1O43516 503 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM50AO95807 157 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R30P59541 319 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 REC114Q7Z4M0 266 aa25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLN5O75503 358 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIX6O95475 246 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS54Q6PEW0 395 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM116Q8NCL8 245 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBN3Q75N90 2809 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EPK0 472 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAP30O75446 220 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAX9P55771 341 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 NMES1Q9C002 83 aa25.27■■□□□ 1.64
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 RELQ04864 619 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A13Q7RTY0 426 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNG8Q8WXS5 425 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA4O00483 81 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSC22D2O75157 780 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCGB2A1O75556 95 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYCSP99999 105 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF320A2RRD8 509 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 RND2P52198 227 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2BFSP57053 126 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB32Q13637 225 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEAN1Q3B7T3 259 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 MGAT4CQ9UBM8 478 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MWP6 167 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A10P60903 97 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL34Q6ZMJ4 242 aa25.23■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 L7N2F9 121 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAMP2P63027 116 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS46E5RG02 174 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM190Q8WZ59 177 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSN3P07498 182 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB3Q92617 1050 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACY3Q96HD9 319 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35E1Q96K37 410 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf1Q9H5F2 150 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 UFC1Q9Y3C8 167 aa25.2■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf70A6NJV1 201 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLC1P0CG04 106 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAMTQ14353 236 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF414Q96IQ9 312 aa25.19■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM213A2RRL7 107 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELLP55199 621 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF600Q6ZNG1 722 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED28Q9H204 178 aa25.18■■□□□ 1.62
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2P5A8MQ11 134 aa25.17■■□□□ 1.62
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