RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	FCN3	O75636	299 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS7	P47929	136 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ROS1	P08922	2347 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559		E7EUB6	86 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SERF1A	O75920	110 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV2-23	P01705	113 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV2-8	P01709	118 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PAXX	Q9BUH6	204 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB3	Q92617	1050 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GV90	55 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CGB1	A6NKQ9	187 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DQA1	P01909	254 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DLX6	P56179	175 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00310	P59036	64 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	AMY1A	P04745	511 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD3	Q14802	87 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MORN5	Q5VZ52	161 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		14.86	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A17	O43808	307 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	BRS3	P32247	399 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZWC4	215 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF14	Q92956	283 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TBX15	Q96SF7	602 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		14.85	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RASL11A	Q6T310	242 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	MISP3	Q96FF7	219 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	PATE2	Q6UY27	113 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TEX45	Q8NA69	505 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP13	Q12802	2813 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	ACACA	Q13085	2346 aa		14.83	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPI3	338 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PEX7	O00628	323 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF329	Q86UD4	541 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GNB4	Q9HAV0	340 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PYY	P10082	97 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PERP	Q96FX8	193 aa		14.83	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	LAMA5	O15230	3695 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK4	O60575	86 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TCL1A	P56279	114 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD5	Q96DB9	178 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	FSTL3	O95633	263 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CRYGC	P07315	174 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04

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