RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 PPP5CP53041 499 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 UCP3P55916 312 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 GRAMD2BQ96HH9 432 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 PDCD10Q9BUL8 212 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 DNAH17Q9UFH2 4485 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 CORTO00230 105 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 CLN5O75503 358 aa12.29□□□□□ -0.44
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CS-214ENST00000548849 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
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CS-214ENST00000548849 PVRIGQ6DKI7 326 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 A0A0B4J293 547 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 SCGB2A1O75556 95 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 IGKV1-5P01602 117 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 PGAM2P15259 253 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 OPRK1P41145 380 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 ETV6P41212 452 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 AKR1C2P52895 323 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 RNF126Q9BV68 326 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 ENY2Q9NPA8 101 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 RYR1P21817 5038 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-214ENST00000548849 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 ATP6V1G2O95670 118 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 PI3P19957 117 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RCVRNP35243 200 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 DHRS2Q13268 280 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF767PQ75MW2 155 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 OR4X1Q8NH49 305 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 DCANP1Q8TF63 244 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 CELA1Q9UNI1 258 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 M0QYG6 137 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 ATG12O94817 140 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RND3P61587 244 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 C12orf74Q32Q52 190 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 TIGITQ495A1 244 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RAB40CQ96S21 281 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 TP53RKQ96S44 253 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GVY2 172 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 P0C879 139 aa12.25□□□□□ -0.45
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CS-214ENST00000548849 TRIM16LQ309B1 348 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 KCTD21Q4G0X4 260 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 PSMG4Q5JS54 123 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 HELTA6NFD8 242 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 M0R2N4 97 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 IGKV1-17P01599 117 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 APOA1P02647 267 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 P0DMU3 169 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 FAM231AP0DMU4 169 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 FAM231CP0DMU5 169 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RPL5P46777 297 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 NDUFAF3Q9BU61 184 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.24□□□□□ -0.45
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CS-214ENST00000548849 MED14OSP0DP75 135 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 NPY1RP25929 384 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 SP6Q3SY56 376 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 Q8WTZ3 238 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 YIPF6Q96EC8 236 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 PKHD1P08F94 4074 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 A0A0G2JRQ6 117 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 LHFPL1Q86WI0 220 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 COPZ2Q9P299 210 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 XCL2Q9UBD3 114 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 U3KQE9 123 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-214ENST00000548849 HPGDSO60760 199 aa12.21□□□□□ -0.45
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