RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CXorf65	A6NEN9	183 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	SCGB2A1	O75556	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	IGKV1-39	P01597	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	IGKV1D-39	P04432	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	ADM	P35318	185 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	RND3	P61587	244 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF124	Q15973	351 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CTF1	Q16619	201 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM230	Q96A57	120 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	ABHD1	Q96SE0	405 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120		A0A0B4J293	547 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	GABARAP	H6UMI1	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120		I3L2K1	104 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CTDSP2	O14595	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CHEK1	O14757	476 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	ST8SIA3	O43173	380 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	GABARAP	O95166	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	IL18	Q14116	193 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	MEF2D	Q14814	521 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	DEFB135	Q30KP9	77 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120		Q6ZWC4	215 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TCF24	Q7RTU0	167 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	GALNT14	Q96FL9	552 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TP53RK	Q96S44	253 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	RNF2	Q99496	336 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CORT	O00230	105 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM50A	O95807	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	IGKV1-5	P01602	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CD5	P06127	495 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	NPPC	P23582	126 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	DHODH	Q02127	395 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	ZNF114	Q8NC26	417 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	RYR2	Q92736	4967 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120		A0A0J9YWU9	116 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120		A0A1W2PS18	150 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	MPTX1	A8MV57	137 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CD74	P04233	296 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	AKAIN1	P0CW23	69 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	SMIM18	P0DKX4	95 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	OPRK1	P41145	380 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	SPCS3	P61009	180 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	SPCS2	Q15005	226 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	LYG2	Q86SG7	212 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	METTL26	Q96S19	204 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	RABAC1	Q9UI14	185 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	6.22	□□□□□ -1.41
DDB1-208	ENST00000537120	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	DFFB	O76075	338 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	OR5AC1	P0C628	307 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	UCP1	P25874	307 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	HTR2B	P41595	481 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	MLANA	Q16655	118 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DDB1-208	ENST00000537120	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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