RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532885.5

RPS6KA4-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A4, human

TSL 3

Gene RPS6KA4, Length 902 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NXPH3	O95157	252 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IL7	P13232	177 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NEURL2	Q9BR09	285 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NDUFB6	O95139	128 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SFT2D2	O95562	160 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TNFRSF9	Q07011	255 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PPP1R1A	Q13522	171 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	NPY1R	P25929	384 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GINS3	Q9BRX5	216 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZMAT4	Q9H898	229 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IFNA10	P01566	189 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CD7	P09564	240 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC25A6	P12236	298 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BMI1	P35226	326 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4X1	Q8NH49	305 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR10C1	Q96KK4	312 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885		U3KQ87	197 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR11H12	B2RN74	326 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CLN5	O75503	358 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM50A	O95807	157 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SLC25A4	P12235	298 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RBKS	Q9H477	322 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SORL1	Q92673	2214 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TSPAN4	O14817	238 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CCDC32	Q9BV29	185 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C9orf170	A2RU37	121 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HOXB5	P09067	269 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	BTC	P35070	178 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	C4orf46	Q504U0	113 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DEFB125	Q8N687	156 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	COQ8A	Q8NI60	647 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RCHY1	Q96PM5	261 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4C46	A6NHA9	309 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CHEK1	O14757	476 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LYRM1	O43325	122 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PITX3	O75364	302 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MED6	O75586	246 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR4E1	P0C645	316 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RND2	P52198	227 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MLANA	Q16655	118 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	S100Z	Q8WXG8	99 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IFNA4	P05014	189 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CD5	P06127	495 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	DHRS2	Q13268	280 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	HAGH	Q16775	308 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	RNF2	Q99496	336 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		12.43	□□□□□ -0.42
RPS6KA4-208	ENST00000532885	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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