RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.64□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0G2JLM5 398 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MFSD2BA6NFX1 497 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM223BA6NKX1 122 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 K7EIM0 57 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JTBO76095 146 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRI3O95415 125 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-11P01762 117 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELANEP08246 267 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGF7P21781 194 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPBWR1P48145 328 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB31Q13636 194 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF266Q14584 549 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLK9Q2XQG4 91 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BTNL8Q6UX41 500 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMMD1Q8N668 190 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF709Q8N972 641 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USMG5Q96IX5 58 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXorf58Q96LI9 332 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZANQ9Y493 2812 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF114Q9Y508 228 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIVEP1P15822 2718 aa6.63□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFP92A6NM28 416 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FNDC10F2Z333 226 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNG7O60262 68 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMB8P28062 276 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VWC2Q2TAL6 325 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TEPPQ6URK8 271 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TREML4Q6UXN2 200 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC51BQ86UW2 128 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4X1Q8NH49 305 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5B12Q96R08 314 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXN2Q99757 166 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.62□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.61□□□□□ -1.35
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T8A6NH00 312 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLN5O75503 358 aa6.61□□□□□ -1.35
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD28P10747 220 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10J1P30954 320 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR183P32249 361 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAMLGP49069 296 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIGITQ495A1 244 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAP18Q8IXM2 172 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST8SIA2Q92186 375 aa6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GUS0 222 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUDT19A8MXV4 375 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGPAT2O15120 278 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPDU1O75352 247 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FABP1P07148 127 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP6V0CP27449 155 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RUNX1Q01196 453 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF90Q03938 601 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXL1Q12952 345 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF152Q8N8N0 203 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THAP8Q8NA92 274 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGST2Q99735 147 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GINS3Q9BRX5 216 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RSG1Q9BU20 258 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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