RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529999.5

PUF60-215, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-215	ENST00000529999	PRH1	P02810	166 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	TRGV3	P03979	118 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	S100A11	P31949	105 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	NHLH2	Q02577	135 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	CD69	Q07108	199 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ARPC5	O15511	151 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	CST7	O76096	145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	NDUFB8	O95169	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	PF4V1	P10720	104 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	HBG1	P69891	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	HBG2	P69892	147 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	DLK1	P80370	383 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	RHOG	P84095	191 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR2F1	Q13607	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ATP6V1F	Q16864	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	MS4A10	Q96PG2	267 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ATP6V0B	Q99437	205 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999		A0A0G2JLM5	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR2J3	O76001	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	MT-CO2	P00403	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OPRK1	P41145	380 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999		A0A0D9SG52	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	CXCL2	P19875	107 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	TPPP2	P59282	170 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ATP5G2	Q06055	141 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	C15orf32	Q32M92	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	FAM209B	Q5JX69	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	TXN2	Q99757	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PUF60-215	ENST00000529999	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	TAAR5	O14804	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	CD28	P10747	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	GAMT	Q14353	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	MLANA	Q16655	118 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	DFFB	O76075	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	MFAP4	P55083	255 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	LILRB2	Q8N423	598 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PUF60-215	ENST00000529999	CD33	P20138	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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