RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 BORCS7Q96B45 105 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 MBD6Q96DN6 1003 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 OSTCQ9NRP0 149 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALYQ9NYX4 217 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIGD1CA8MV81 97 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNAI2O43623 268 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 S100A7P31151 101 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 STUMQ69YW2 141 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 PATE2Q6UY27 113 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2V2Q96R30 315 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 COX11Q9Y6N1 276 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 REG1AP05451 166 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CT45A6P0DMU7 189 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CT45A5P0DMU8 189 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CT45A7P0DMV0 189 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CA7P43166 264 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCTAP57738 103 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
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RAPGEF6-211ENST00000512611 CUBNO60494 3623 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 COL12A1Q99715 3063 aa5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMB11A5LHX3 300 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 H0YJW9 148 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF137PP52743 207 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2V1Q13404 147 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 LEMD1Q68G75 181 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
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RAPGEF6-211ENST00000512611 RITA1Q96K30 269 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 JPT1Q9UK76 154 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 LY96Q9Y6Y9 160 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.54□□□□□ -1.52
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RAPGEF6-211ENST00000512611 KLK10O43240 276 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSBP1O75506 76 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CGB3P0DN86 165 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CGB7P0DN87 165 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 DLX1P56177 255 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q6ZT83 130 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2T8A6NH00 312 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 SRRM5B3KS81 715 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 F2RL2O00254 374 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOX4O94842 621 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 WDR73Q6P4I2 378 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR4S2Q8NH73 311 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 GTSF1Q8WW33 167 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ENY2Q9NPA8 101 aa5.54□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
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RAPGEF6-211ENST00000512611 HLA-DQA1P01909 254 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACP1P24666 158 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAB31Q13636 194 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF329Q86UD4 541 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCL13Q99616 98 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHODLQ9H9P2 273 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 CGB1A6NKQ9 187 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 MGST3O14880 152 aa5.53□□□□□ -1.52
RAPGEF6-211ENST00000512611 FCN3O75636 299 aa5.53□□□□□ -1.52
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