RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	INSL3	P51460	131 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	NPFF	O15130	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CECR9	P0C854	216 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	MRAP2	Q96G30	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	GDF9	O60383	454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	LTBR	P36941	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PGP	A6NDG6	321 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467		F5H697	171 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	EREG	O14944	169 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CEACAM4	O75871	244 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PSG2	P11465	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	MFAP2	P55001	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	MORN2	Q502X0	79 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	COL4A2	P08572	1712 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	UBE2E1	P51965	193 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	GPX1	P07203	203 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	FXYD3	Q14802	87 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PEX7	O00628	323 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	NEU1	Q99519	415 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467		A8MWV9	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TOMM40	O96008	361 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CTSB	P07858	339 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PRTN3	P24158	256 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467		Q1RN00	199 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	RRH	O14718	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	TNFSF12	O43508	249 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	GLI4	P10075	376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	SELL	P14151	372 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PLAUR	Q03405	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	FUT5	Q11128	374 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	NPS	P0C0P6	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	GAS1	P54826	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PTPN13-209	ENST00000511467	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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