RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTAP10-2	P60368	255 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276		Q56UQ5	140 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIQK	Q629K1	86 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINE2	P07093	398 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	RCVRN	P35243	200 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	BAK1	Q16611	211 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276		Q5VSD8	79 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276		Q6ZS49	121 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	LILRB2	Q8N423	598 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ST8SIA2	Q92186	375 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276		K7EIM0	57 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ST8SIA3	O43173	380 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	OR13C7	P0DN81	318 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	NAT1	P18440	290 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TBP	P20226	339 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	AP3S2	P59780	193 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	IFT46	Q9NQC8	304 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	KLK11	Q9UBX7	282 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	RABAC1	Q9UI14	185 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC22A5	O76082	557 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	INPP1	P49441	399 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	EMP1	P54849	157 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	WT1-AS	Q06250	92 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	HOGA1	Q86XE5	327 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	GPHA2	Q96T91	129 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	VSIR	Q9H7M9	311 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	UPK2	O00526	184 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	HTN3	P15516	51 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TAS2R19	P59542	299 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	IFITM3	Q01628	133 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	BEST4	Q8NFU0	473 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276		K7EQG2	157 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF688	P0C7X2	276 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	AKAIN1	P0CW23	69 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TAS2R46	P59540	309 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	DEFA1	P59665	94 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	DEFA3	P59666	94 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ASAH1	Q13510	395 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	FRZB	Q92765	325 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	GINS3	Q9BRX5	216 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ATG101	Q9BSB4	218 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	XCL2	Q9UBD3	114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM189	A5PLL7	270 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	XG	P55808	180 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	MEF2D	Q14814	521 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	DKK2	Q9UBU2	259 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	FAT1	Q14517	4588 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FAM53C-208	ENST00000511276	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FAM53C-208	ENST00000511276	CENPX	A8MT69	81 aa		9.33	□□□□□ -0.92

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