RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM230Q96A57 120 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 ENY2Q9NPA8 101 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 SPP1P10451 314 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 MIFP14174 115 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 HLA-DMBP28068 263 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 COMMD3Q9UBI1 195 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 OPRK1P41145 380 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 P2RY1P47900 373 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 VBP1P61758 197 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 AGRNO00468 2067 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0B4J293 547 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 KNCNA6PVL3 124 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 K7EQG2 157 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 M0QYG6 137 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 CLN5O75503 358 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1-5P01602 117 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 APOA1P02647 267 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF688P0C7X2 276 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ETV6P41212 452 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TMBIM6P55061 237 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RND3P61587 244 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 PI3P19957 117 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 CRYBB3P26998 211 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 PPP5CP53041 499 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 PIGPP57054 158 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TRIM16LQ309B1 348 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZTC4 211 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 OR4X1Q8NH49 305 aa11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TP53RKQ96S44 253 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.86□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 HELTA6NFD8 242 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 P0C879 139 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 C4BPBP20851 252 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 DHRS2Q13268 280 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 MLANAQ16655 118 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 DCANP1Q8TF63 244 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 COPZ2Q9P299 210 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 X6R8D5 127 aa11.85□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 HPGDSO60760 199 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ELK1P19419 428 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 TIGITQ495A1 244 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 Q8WTZ3 238 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 RNF126Q9BV68 326 aa11.84□□□□□ -0.51
ITGA3-211ENST00000508100 HERC2O95714 4834 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM25AB3EWG3 89 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM25CB3EWG5 89 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 FAM25GB3EWG6 89 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 H3BMQ9 156 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 IGKV1-17P01599 117 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 SPCS2Q15005 226 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 SP6Q3SY56 376 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 PSMG4Q5JS54 123 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 RAB40CQ96S21 281 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 KLK11Q9UBX7 282 aa11.83□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 TBPP20226 339 aa11.82□□□□□ -0.52
ITGA3-211ENST00000508100 HTR2BP41595 481 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms