RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 FXYD7P58549 80 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SLC38A11Q08AI6 406 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 PLCXD2Q0VAA5 305 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 FUT5Q11128 374 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 PP632Q6XCG6 107 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF767PQ75MW2 155 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 LHFPL1Q86WI0 220 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 PRR15Q8IV56 129 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TSTD1Q8NFU3 115 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 UBALD1Q8TB05 177 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 MND1Q9BWT6 205 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OTORQ9NRC9 128 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 MRC2Q9UBG0 1479 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TRAV5A0A0B4J249 113 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 A0A0D9SEW6 157 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1B0GW64 132 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OR2T1O43869 369 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 CDS2O95674 445 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OR2H2O95918 312 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 EVI2AP22794 236 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 AKR1C1Q04828 323 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 LINC01554Q52M75 96 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZQT7 251 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SMIM3Q9BZL3 60 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 CALML5Q9NZT1 146 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 H3BQ85 93 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IGLV7-43P04211 117 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IL4P05112 153 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 S100PP25815 95 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 CLDND2Q8NHS1 167 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 PPTC7Q8NI37 304 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 OR8D2Q9GZM6 311 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 C16orf95Q9H693 158 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 CACNA1SQ13698 1873 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 MYH10P35580 1976 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SCN1AP35498 2009 aa2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 DOCK9Q9BZ29 2069 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 REREQ9P2R6 1566 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 MEIKINA0A087WXM9 373 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IRGMA1A4Y4 181 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 M0R2Z0 102 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TXNDC9O14530 226 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 GGCTO75223 188 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 LYZL6O75951 148 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 DPM2O94777 84 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 NPYP01303 97 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IGHV3-53P01767 116 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 UCHL1P09936 223 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 CCL5P13501 91 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 EBI3Q14213 229 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 IFT20Q8IY31 132 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 TERB2Q8NHR7 220 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 MUC7Q8TAX7 377 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 WFDC5Q8TCV5 224 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.84□□□□□ -1.95
PDE4D-215ENST00000506510 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms