RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 OR5AC2Q9NZP5 309 aa13.63□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 H0YIZ8 118 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 ACSM6Q6P461 480 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM116Q8NCL8 245 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 OR4F17Q8NGA8 305 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 OR4X1Q8NH49 305 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 OR4F4Q96R69 305 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 RNF126Q9BV68 326 aa13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM24AA6NFZ4 105 aa13.61□□□□□ -0.23
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CTDSP1-215ENST00000498160 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 METTL15P1P0C7V9 234 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP10-3P60369 221 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.61□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 MFSD2BA6NFX1 497 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 PMS2P5A8MQ11 134 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 PRSS46E5RG02 174 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 M0QZ24 198 aa13.6□□□□□ -0.23
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CTDSP1-215ENST00000498160 IGHV3-11P01762 117 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 FABP1P07148 127 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 ZP3P21754 424 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 RPL12P30050 165 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 11.9
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CTDSP1-215ENST00000498160 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF546Q86UE3 836 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 LILRB2Q8N423 598 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 AQP10Q96PS8 301 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 GNB4Q9HAV0 340 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa13.6□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 CLN5O75503 358 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 MYCNOSP40205 109 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC38A11Q08AI6 406 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 OR1S2Q8NGQ3 325 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 DPF1Q92782 380 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 ST6GAL2Q96JF0 529 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC140Q96MF4 163 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 HSPB11Q9Y547 144 aa13.59□□□□□ -0.23
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1B0GVG6 124 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 IGSF23A1L1A6 192 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 HMSDA8MTL9 139 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 LINC01619G3V211 115 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 TGOLN2O43493 480 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 DFFBO76075 338 aa13.58□□□□□ -0.24
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CTDSP1-215ENST00000498160 ARL3P36405 182 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 RND2P52198 227 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF616Q08AN1 781 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CLEC19AQ6UXS0 136 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 MDFIQ99750 246 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM147Q9BVK8 224 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.58□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CST7O76096 145 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 GPR183P32249 361 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 AKR1C1Q04828 323 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 GAMTQ14353 236 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM144Q7Z5S9 345 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 UBAC2Q8NBM4 344 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 UQCC1Q9NVA1 299 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 TNFSF18Q9UNG2 199 aa13.57□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A1W2PRX2 142 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 MPDU1O75352 247 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 C1QBP02746 253 aa13.56□□□□□ -0.24
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CTDSP1-215ENST00000498160 OR2F1Q13607 317 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 RAB31Q13636 194 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 FHL3Q13643 280 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF345Q14585 488 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 RPEL1Q2QD12 228 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 C8orf86Q6ZUL3 223 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM217Q8N7C4 229 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 OR11H1Q8NG94 326 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 NPIPB3Q92617 1050 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ACY3Q96HD9 319 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 HYLS1Q96M11 299 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 OR5B12Q96R08 314 aa13.56□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 SMCO3A2RU48 225 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 OR2T8A6NH00 312 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 G3V3Q6 166 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CCL24O00175 119 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 CFDP00746 253 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 PF4P02776 101 aa13.55□□□□□ -0.24
CTDSP1-215ENST00000498160 OR10J1P30954 320 aa13.55□□□□□ -0.24
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