RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.35□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1W2PRE2 83 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 M0QZ24 198 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 CORTO00230 105 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV3-15P01624 115 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV1-16P04430 117 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 MSMPQ1L6U9 139 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF479Q96JC4 524 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 OR8B2Q96RD0 313 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 TRIB1Q96RU8 372 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 CBY3A6NI87 242 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 C2orf70A6NJV1 201 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 SRRM5B3KS81 715 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 H0YJW9 148 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 CD24P25063 80 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 S100A7P31151 101 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 TBR1Q16650 682 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 VWA1Q6PCB0 445 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 Q6ZT83 130 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 MBD6Q96DN6 1003 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 SGK494Q96LW2 274 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 VWC2LB2RUY7 222 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 LIPFP07098 398 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 ACP1P24666 158 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PRCDQ00LT1 54 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 RNF151Q2KHN1 245 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 FBLN7Q53RD9 439 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 MUC3AQ02505 3323 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 FNDC10F2Z333 226 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV3-48P01763 117 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 GNG5P63218 68 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 CR1LQ2VPA4 569 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 MUC15Q8N387 334 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 OR5B3Q8NH48 314 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 SPXQ9BT56 116 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PRNDQ9UKY0 176 aa8.33□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 HIGD1CA8MV81 97 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 C21orf140B9A014 251 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 UPK2O00526 184 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 TNFSF4P23510 183 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF329Q86UD4 541 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PNKDQ8N490 385 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 LOXL4Q96JB6 756 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PSMB11A5LHX3 300 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 K7EP13 123 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PEX7O00628 323 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PLAUP00749 431 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 CGB3P0DN86 165 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 CGB7P0DN87 165 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 RND1Q92730 232 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.32□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 hDV102S1A0JD36 115 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 CRYGCP07315 174 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 MC5RP33032 325 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 CA7P43166 264 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 SCGB2A2Q13296 93 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 VAMP3Q15836 100 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 RTL8BQ17RB0 113 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 MPV17L2Q567V2 206 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 TCF24Q7RTU0 167 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 OR2V2Q96R30 315 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
VWA3B-217ENST00000489630 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms