RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 BTNL8Q6UX41 500 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 SLC16A13Q7RTY0 426 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 SBSPONQ8IVN8 264 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 C20orf24Q9BUV8 137 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 PRR13Q9NZ81 148 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.34■□□□□ 0.53
EHD1-211ENST00000489379 NDUFB6O95139 128 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SFT2D2O95562 160 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SLC25A6P12236 298 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TNFRSF9Q07011 255 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 OR10C1Q96KK4 312 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 ZMAT4Q9H898 229 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TMEM50AO95807 157 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 IGHV3-48P01763 117 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 OR4X1Q8NH49 305 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 GINS3Q9BRX5 216 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TMED3Q9Y3Q3 217 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 U3KQ87 197 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 DNAH9Q9NYC9 4486 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 YIF1AO95070 293 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 IL7P13232 177 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R1AQ13522 171 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 ZNF600Q6ZNG1 722 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 OR1S1Q8NH92 325 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 CLN5O75503 358 aa18.3■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SLC25A4P12235 298 aa18.3■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 NPY1RP25929 384 aa18.3■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 BMI1P35226 326 aa18.3■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SMPXQ9UHP9 88 aa18.3■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.29■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TSPAN4O14817 238 aa18.29■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 CD7P09564 240 aa18.29■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 OR52B4Q8NGK2 314 aa18.29■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 DTD1Q8TEA8 209 aa18.29■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 OR11H12B2RN74 326 aa18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 CD5P06127 495 aa18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 ZNF414Q96IQ9 312 aa18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TM2D3Q9BRN9 247 aa18.28■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 PITX3O75364 302 aa18.27■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 MED6O75586 246 aa18.27■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 IFNA10P01566 189 aa18.27■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 TMEM116Q8NCL8 245 aa18.27■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 RBKSQ9H477 322 aa18.27■□□□□ 0.52
EHD1-211ENST00000489379 NXPH3O95157 252 aa18.26■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 TOMM20LQ6UXN7 152 aa18.26■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 CCDC32Q9BV29 185 aa18.26■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa18.26■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 C9orf170A2RU37 121 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 CHEK1O14757 476 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 MLANAQ16655 118 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 COQ8AQ8NI60 647 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 S100ZQ8WXG8 99 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 RCHY1Q96PM5 261 aa18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 BTCP35070 178 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 PRSS54Q6PEW0 395 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 DEFB125Q8N687 156 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 SPATA25Q9BR10 227 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 OR4C46A6NHA9 309 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 A6NHS1 94 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 OR4E1P0C645 316 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 HAGHQ16775 308 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 LYG2Q86SG7 212 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 FAM110AQ9BQ89 295 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 TMEM231Q9H6L2 316 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 SRD5A3Q9H8P0 318 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 ZFAND3Q9H8U3 227 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 SELENOKQ9Y6D0 94 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 STAB2Q8WWQ8 2551 aa18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 LYRM1O43325 122 aa18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 HOXB5P09067 269 aa18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 RND2P52198 227 aa18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 DHRS2Q13268 280 aa18.22■□□□□ 0.51
EHD1-211ENST00000489379 GGNBP1Q5YKI7 109 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms