RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486032.1

COPS3-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, human

TSL 2

Gene COPS3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS3-208	ENST00000486032	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		H3BUA1	57 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CCNK	O75909	580 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TMEM50A	O95807	157 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	RAB11A	P62491	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	DPF1	Q92782	380 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CITED1	Q99966	193 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	NMES1	Q9C002	83 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		U3KQ87	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		A0A087WW49	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		H0YIZ8	118 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		K7EIM0	57 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CORT	O00230	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	GNG7	O60262	68 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	DEDD	O75618	318 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CST7	O76096	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	MPC2	O95563	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PF4	P02776	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PET100	P0DJ07	73 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	GPR183	P32249	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	MFAP4	P55083	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PAX9	P55771	341 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	IL15RA	Q13261	267 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		Q5BKY6	102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CXorf58	Q96LI9	332 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	RAB40C	Q96S21	281 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	MBD2	Q9UBB5	411 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		E5RGE8	158 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	LINC01619	G3V211	115 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		I3L2K1	104 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032		M0QZ24	198 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	TSC22D2	O75157	780 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	CLEC3B	P05452	202 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	ARL3	P36405	182 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	NPBWR1	P48145	328 aa		4.34	□□□□□ -1.71
COPS3-208	ENST00000486032	RND2	P52198	227 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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