RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, human

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNKSR1-208	ENST00000484874	NDUFA4	O00483	81 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM50A	O95807	157 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	OPRK1	P41145	380 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	MLANA	Q16655	118 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	GNG7	O60262	68 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	PRAF2	O60831	178 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	SLC25A4	P12235	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	SORL1	Q92673	2214 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874		K7EMT4	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	CLN5	O75503	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	FOLR2	P14207	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	CBLN1	P23435	193 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	RAB11A	P62491	216 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	WRB	O00258	174 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	IFNA4	P05014	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	IAPP	P10997	89 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	CD69	Q07108	199 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	SPN	P16150	400 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	TAS2R30	P59541	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CNKSR1-208	ENST00000484874	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.71	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874		K7EIL1	84 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	CCS	O14618	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	PTTG1	O95997	202 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	PAX9	P55771	341 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	IL15RA	Q13261	267 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGKV1-17	P01599	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	GP9	P14770	177 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	RND2	P52198	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	NPIPB3	Q92617	1050 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	GAMT	Q14353	236 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CNKSR1-208	ENST00000484874	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22

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