RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RABAC1Q9UI14 185 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 MYCBP2O75592 4640 aa6.81□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 AGRNO00468 2067 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0B4J293 547 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 KNCNA6PVL3 124 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 K7EQG2 157 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1-5P01602 117 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF688P0C7X2 276 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 MIFP14174 115 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPAN5P62079 268 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 GPX8Q8TED1 209 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 Q9H521 79 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 X6R8D5 127 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM50AO95807 157 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 P0C879 139 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SPP1P10451 314 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 NPPCP23582 126 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CRYBB3P26998 211 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SNCAP37840 140 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 P2RY1P47900 373 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP5CP53041 499 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 UCP3P55916 312 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35G3Q8N808 338 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL26Q96S19 204 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PS18 150 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CLN5O75503 358 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKV1-17P01599 117 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 PI3P19957 117 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RCVRNP35243 200 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ETV6P41212 452 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZR54 194 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 DCANP1Q8TF63 244 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF126Q9BV68 326 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 CELA1Q9UNI1 258 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-210ENST00000481231 M0QYG6 137 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V1G2O95670 118 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 IFNA17P01571 189 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 AMBPP02760 352 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 P0DMU3 169 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM231AP0DMU4 169 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM231CP0DMU5 169 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1C2P52895 323 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 RND3P61587 244 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 TNP2Q05952 138 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 MLANAQ16655 118 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 C12orf74Q32Q52 190 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 TIGITQ495A1 244 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4X1Q8NH49 305 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 TP53RKQ96S44 253 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 EPM2AB3EWF7 344 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 CORTO00230 105 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 APOA1P02647 267 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 PGAM2P15259 253 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 OPRK1P41145 380 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 PIGPP57054 158 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRS2Q13268 280 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMG4Q5JS54 123 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZRM9 215 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM230Q96A57 120 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 YIPF6Q96EC8 236 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB40CQ96S21 281 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 U3KQE9 123 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.75□□□□□ -1.33
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