RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 K7EQG2 157 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 GNG7O60262 68 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 MIFP14174 115 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 PPP5CP53041 499 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 HERV-K104P61576 105 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 SPINK9Q5DT21 86 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 IDNKQ5T6J7 187 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 SPARTQ8N0X7 666 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 MOB3AQ96BX8 217 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 SEC22AQ96IW7 307 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 EHFQ9NZC4 300 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 RABAC1Q9UI14 185 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF688P0C7X2 276 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 PSMB9P28065 219 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF575Q86XF7 245 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF114Q8NC26 417 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 DIABLOQ9NR28 239 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 SSR3Q9UNL2 185 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0A6YYH2 397 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 A6NJ64 397 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 GPR31O00270 319 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 CD5P06127 495 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 NPPCP23582 126 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 CBX5P45973 191 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 PRCDQ00LT1 54 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 OR4A16Q8NH70 328 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 DCANP1Q8TF63 244 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 NUDT11Q96G61 164 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 RAB40CQ96S21 281 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 GINS3Q9BRX5 216 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0B4J293 547 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 AMBPP02760 352 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 P0DMU3 169 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 FAM231AP0DMU4 169 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 FAM231CP0DMU5 169 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 SPP1P10451 314 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 CRYBB3P26998 211 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 TGFBR1P36897 503 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 NPBWR1P48145 328 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 HSPA13P48723 471 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZR54 194 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 BORCS5Q969J3 196 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 TSC22D3Q99576 134 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 IFT46Q9NQC8 304 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-208ENST00000479480 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV1-5P01602 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 HLA-DMAP28067 261 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 ETV6P41212 452 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 P2RY1P47900 373 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 TAS2R20P59543 309 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 TIGITQ495A1 244 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 XCL2Q9UBD3 114 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PS18 150 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 CLN5O75503 358 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 IFNA10P01566 189 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV1-17P01599 117 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 HRH1P35367 487 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00310P59036 64 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 DEFB1P60022 68 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 GABARAPL2P60520 117 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 DHRS2Q13268 280 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 PSMG4Q5JS54 123 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-208ENST00000479480 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms