RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CXCL16Q9H2A7 254 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CENPHQ9H3R5 247 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 BIN3Q9NQY0 253 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 OBSL1O75147 1896 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 FMN1Q68DA7 1419 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 STRCQ7RTU9 1775 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 CACNA1GO43497 2377 aa2.41□□□□□ -2.02
RABGGTB-205ENST00000462042 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP12-3P60328 96 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SNCBQ16143 134 aa2.4□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0D9SEW6 157 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 OR51F1A6NGY5 319 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP5D1E7EU14 171 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 H0YJX3 145 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 C19orf84I3L1E1 186 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 SERPINB1P30740 379 aa2.39□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TCTAP57738 103 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZTI0 123 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC9Q8WXX5 260 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf40Q8WZ69 217 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM133Q9H2Q1 129 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CUL9Q8IWT3 2517 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF860A6NHJ4 632 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 H7C1C5 153 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD2P54710 66 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 LCN6P62502 163 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ERHP84090 104 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 WFDC5Q8TCV5 224 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ACER3Q9NUN7 267 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa2.38□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF24Q5T7B8 1368 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 NUP210LQ5VU65 1888 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 STRCP1A6NGW2 1772 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 LY6LH3BQJ8 138 aa2.37□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 RHEBQ15382 184 aa2.37□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.37□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 IMUPQ9GZP8 106 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MIXL1Q9H2W2 232 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SMARCA4P51532 1647 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 EML6Q6ZMW3 1958 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1B0GV72 72 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 HMSDA8MTL9 139 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 CYB5BO43169 146 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SHBGP04278 402 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 IFI30P13284 250 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 IDO1P14902 403 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 AQP4P55087 323 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM258P61165 79 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 RRN3P1Q2M238 152 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM15Q7Z3B0 74 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 STX19Q8N4C7 294 aa2.36□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM106AQ96A25 262 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 LYSMD1Q96S90 227 aa2.36□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 HSPB9Q9BQS6 159 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 DDA1Q9BW61 102 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 OSTCQ9NRP0 149 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 SSR3Q9UNL2 185 aa2.36□□□□□ -2.03
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RABGGTB-205ENST00000462042 BAHCC1Q9P281 2608 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A087X0T9 212 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 MEIS3P1A6NDR6 274 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 J3QQQ9 107 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR31O00270 319 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 NAPSAO96009 420 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL26P61254 145 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-205ENST00000462042 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.35□□□□□ -2.03
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