RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 K7EQG2 157 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HLA-DMAP28067 261 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 OPRK1P41145 380 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 PPP5CP53041 499 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TAS2R20P59543 309 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 DHRS2Q13268 280 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 PSMG4Q5JS54 123 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 CADM3Q8N126 398 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM230Q96A57 120 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SEC22AQ96IW7 307 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 ENY2Q9NPA8 101 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 RTL8CO15255 209 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA10P01566 189 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA17P01571 189 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1-39P01597 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1D-39P04432 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NPY1RP25929 384 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 AKR1C2P52895 323 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 EMP1P54849 157 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 C12orf74Q32Q52 190 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 RAB26Q9ULW5 256 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HELTA6NFD8 242 aa7.42□□□□□ -1.22
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DDX39B-211ENST00000449757 TMEM50AO95807 157 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 PGAM2P15259 253 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS3P35030 304 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NEDD8Q15843 81 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TIGITQ495A1 244 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF575Q86XF7 245 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 XCL2Q9UBD3 114 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NACAE9PAV3 2078 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 CLN5O75503 358 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA21P01568 189 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 CRYBB3P26998 211 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TGFBR1P36897 503 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 DCANP1Q8TF63 244 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HTN3P15516 51 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 NAT1P18440 290 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM16LQ309B1 348 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 SNX29P2Q8IUI4 249 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 RAB40CQ96S21 281 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 Q9H521 79 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-211ENST00000449757 HSPG2P98160 4391 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 M0QYG6 137 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 ATG12O94817 140 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV1-5P01602 117 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 PI3P19957 117 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 RCVRNP35243 200 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 ETV6P41212 452 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 FXYD7P58549 80 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 MLANAQ16655 118 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 OR4X1Q8NH49 305 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0B4J293 547 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM127O75204 238 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV3-20P01619 116 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 RND2P52198 227 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 PIGPP57054 158 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 GLMPQ8WWB7 406 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-211ENST00000449757 TP53RKQ96S44 253 aa7.38□□□□□ -1.23
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