RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445427.1

PRKCQ-AS1-202, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCQ-AS1, Length 1,133 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC24A4Q8NFF2 622 aa16.27■□□□□ 0.2
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR52B4Q8NGK2 314 aa16.25■□□□□ 0.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GINS3Q9BRX5 216 aa16.24■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR11H12B2RN74 326 aa16.23■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CLN5O75503 358 aa16.23■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZNF414Q96IQ9 312 aa16.23■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RBKSQ9H477 322 aa16.23■□□□□ 0.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16.23■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 U3KQ87 197 aa16.23■□□□□ 0.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SLC25A6P12236 298 aa16.22■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ETFRF1Q6IPR1 90 aa16.22■□□□□ 0.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TSPAN4O14817 238 aa16.21■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 BMI1P35226 326 aa16.21■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MLANAQ16655 118 aa16.21■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TM2D3Q9BRN9 247 aa16.21■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa16.21■□□□□ 0.19
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SRD5A3Q9H8P0 318 aa16.21■□□□□ 0.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HAGHQ16775 308 aa16.2■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.2■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LINC00299Q6ZSB3 139 aa16.2■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TMEM170AQ8WVE7 144 aa16.2■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 WFDC10AQ9H1F0 79 aa16.2■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C9orf170A2RU37 121 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FAM90A26D6RGX4 464 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CHEK1O14757 476 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PITX3O75364 302 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HOXB5P09067 269 aa16.19■□□□□ 0.18
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 SPATA25Q9BR10 227 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 ZFAND3Q9H8U3 227 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 FLVCR2Q9UPI3 526 aa16.19■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR4C46A6NHA9 309 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 MED6O75586 246 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 OR4E1P0C645 316 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RND2P52198 227 aa16.18■□□□□ 0.18
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PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 COQ8AQ8NI60 647 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 RNF2Q99496 336 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CCDC32Q9BV29 185 aa16.18■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LYRM1O43325 122 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IFNA4P05014 189 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 DHRS2Q13268 280 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 TIGITQ495A1 244 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 C4orf46Q504U0 113 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 GGNBP1Q5YKI7 109 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 LYG2Q86SG7 212 aa16.17■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 IGKV1-17P01599 117 aa16.16■□□□□ 0.18
PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 CD5P06127 495 aa16.16■□□□□ 0.18
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