RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 NEURL2Q9BR09 285 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 NMES1Q9C002 83 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 C15orf61A6NNL5 157 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 PPP5D1E7EU14 171 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 WRBO00258 174 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 ST8SIA3O43173 380 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 PITX3O75364 302 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 CRYGCP07315 174 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 RAB32Q13637 225 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 SPINK9Q5DT21 86 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 ASB13Q8WXK3 278 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 K7EPK0 472 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 CYB5BO43169 146 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 IFNA17P01571 189 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 ARL3P36405 182 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 WT1-ASQ06250 92 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 OR5B3Q8NH48 314 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PRAME-210ENST00000442481 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 BMPR1BO00238 502 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SSSCA1O60232 199 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MPC2O95563 127 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FGF2P09038 288 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CD81P60033 236 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TNFRSF9Q07011 255 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 IL15RAQ13261 267 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 Q5BKY6 102 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FAM209BQ5JX69 171 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 RBKSQ9H477 322 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 THYN1Q9P016 225 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 G3V3Q6 166 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MED6O75586 246 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR2C1O95371 312 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PET100P0DJ07 73 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 IAPPP10997 89 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 GPR183P32249 361 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SPCS3P61009 180 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ID3Q02535 119 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FGL1Q08830 312 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 THAP6Q8TBB0 222 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MISP3Q96FF7 219 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CXorf58Q96LI9 332 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CCDC140Q96MF4 163 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 MBD2Q9UBB5 411 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ZNF320A2RRD8 509 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 H0YIZ8 118 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 L7N2F9 121 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 SYNGR2O43760 224 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 RLN2P04090 185 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 CSN3P07498 182 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 VAMP2P63027 116 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PRCDQ00LT1 54 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 ZFP69Q49AA0 526 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 AARDQ4LEZ3 155 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 OR52E5Q8NH55 327 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-210ENST00000442481 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.81□□□□□ -1
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