RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 JKAMPQ9P055 326 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JLM5 398 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 C15orf62A8K5M9 175 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DRB1P01911 266 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10J4P0C629 311 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF32P17041 273 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC11AP67812 179 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01559Q495D7 138 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 PSG11Q9UQ72 335 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 LEPROTL1O95214 131 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM54Q969K7 222 aa6.91□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.91□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPB8 328 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNGR1O43759 233 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 AGFG2O95081 481 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 HBZP02008 142 aa6.91□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 OPRK1P41145 380 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TREML4Q6UXN2 200 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 GCM1Q9NP62 436 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 F2RL2O00254 374 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM4O75871 244 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM27BQ5VT28 67 aa6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR52E5Q8NH55 327 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 C21orf140B9A014 251 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BRM9 83 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 ISLRO14498 428 aa6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-203ENST00000439720 PSG3Q16557 428 aa6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-203ENST00000439720 TCTAP57738 103 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL7P80098 99 aa6.9□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.9□□□□□ -1.31
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV2-8P01709 118 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 P0C879 139 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 COX8AP10176 69 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 REG1BP48304 166 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF766Q5HY98 468 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP35Q8NFH5 326 aa6.89□□□□□ -1.31
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