RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM106CPP0CH98 169 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 GAMTQ14353 236 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 Q8N9W7 124 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF114Q8NC26 417 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 RAB2AP61019 212 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 Q96MF0 132 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 FNDC10F2Z333 226 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 SSTP61278 116 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 CX3CL1P78423 397 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN15O95858 294 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 S100A8P05109 93 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 ATG101Q9BSB4 218 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT19A8MXV4 375 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV3-48P01763 117 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-201ENST00000284957 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.38□□□□□ -1.23
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RABGEF1-201ENST00000284957 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 J3QLI3 93 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DRB1P01911 266 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 AMY1AP04745 511 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00869P0C866 280 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 LCN15Q6UWW0 184 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-201ENST00000284957 STPG3Q8N7X2 389 aa7.38□□□□□ -1.23
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