RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ZNF525Q8N782 197 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 MRAPQ8TCY5 172 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SMIM8Q96KF7 97 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GPR132Q9UNW8 380 aa6.56□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TMEM50AO95807 157 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OR2H2O95918 312 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 DNAL4O96015 105 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 VSIG8P0DPA2 414 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PLA2G2AP14555 144 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 MRAP2Q96G30 205 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GAGE13Q4V321 117 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 C10orf128Q5T292 105 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IMMP2LQ96T52 175 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PP11 408 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PPE3 182 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PAX2Q02962 417 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 A0A1B0GWJ7 208 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NDUFB8O95169 186 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 AMBPP02760 352 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CD1AP06126 327 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ZNF688P0C7X2 276 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 C1QL4Q86Z23 238 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SCN2AQ99250 2005 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.55□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SCTP09683 121 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PSG1P11464 419 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PAX1P15863 534 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PRNTQ86SH4 94 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GBF1Q92538 1859 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GAGE12BA1L429 117 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CFAP161Q6P656 301 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ST20Q9HBF5 79 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 A0A0G2JMM0 328 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 A0A1W2PPB8 328 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TMEM189A5PLL7 270 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CEACAM4O75871 244 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SPINK8P0C7L1 97 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 APELAP0DMC3 54 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CGB3P0DN86 165 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PSG2P11465 335 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 ZNF843Q8N446 348 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 USMG5Q96IX5 58 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 IL36BQ9NZH7 164 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TCF23Q7RTU1 214 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OR52E5Q8NH55 327 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NEU1Q99519 415 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SDK2Q58EX2 2172 aa6.54□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 A8MWV9 139 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 MST1P26927 711 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 C2orf83Q53S99 150 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 HBBP68871 147 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 C10orf111Q8N326 155 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SPSB4Q96A44 273 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 CST9LQ9H4G1 147 aa6.53□□□□□ -1.36
USP3-201ENST00000268049 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.53□□□□□ -1.36
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