RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 NEU1Q99519 415 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 JKAMPQ9P055 326 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PSG8Q9UQ74 426 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 HTN1P15515 57 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 TFPI2P48307 235 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00477Q96M19 166 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GWJ7 208 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 C7orf71A4D174 169 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZS92 163 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 CELA3BP08861 270 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 METRNQ9UJH8 293 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PINLYPA6NC86 204 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5G3P48201 142 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 SEC11AP67812 179 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 PAX8Q06710 450 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP161Q6P656 301 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 NUDT11Q96G61 164 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM231BA6NCW3 169 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 DPM2O94777 84 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 GAFA1Q96PS6 74 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 TCF21O43680 179 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 STHQ8IWL8 128 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 E9PQ18 207 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 ZNF492Q9P255 531 aa7.46□□□□□ -1.21
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PTPRB-201ENST00000261266 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 J3QLI3 93 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 CD55P08174 381 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 LINC00311Q8N616 119 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 LINC01587Q99440 93 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 H0YJW9 148 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRB-201ENST00000261266 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 HIGD1CA8MV81 97 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PRR32B1ATL7 298 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV3-15P01624 115 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TEX38Q6PEX7 206 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 LILRA1O75019 489 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 CT83Q5H943 113 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-201ENST00000261266 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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