RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 HIPK2Q9H2X6 1198 aa16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 IZUMO1RA6ND01 250 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A26D6RGX4 464 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 TMEM50AO95807 157 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 C8orf88P0DMB2 117 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 CBLN1P23435 193 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 DUSP18Q8NEJ0 188 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 CACNG8Q8WXS5 425 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 TMEM190Q8WZ59 177 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 U3KQ87 197 aa16.87■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA4O00483 81 aa16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 NPY1RP25929 384 aa16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 ID3Q02535 119 aa16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 DEFB114Q30KQ6 69 aa16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 OR4D5Q8NGN0 318 aa16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 OR10C1Q96KK4 312 aa16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 GP9P14770 177 aa16.85■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 OPRK1P41145 380 aa16.85■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 NRARPQ7Z6K4 114 aa16.85■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 OR4X1Q8NH49 305 aa16.85■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.85■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 NPBWR1P48145 328 aa16.84■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 ELLP55199 621 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 MLXQ9UH92 298 aa16.84■□□□□ 0.29
SYF2-201ENST00000236273 C15orf62A8K5M9 175 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 SYNGR2O43760 224 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 GNG7O60262 68 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 CLN5O75503 358 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IFNA10P01566 189 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IAPPP10997 89 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 PRSS54Q6PEW0 395 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 UXS1Q8NBZ7 420 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 SELENOKQ9Y6D0 94 aa16.83■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF785A8K8V0 405 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 LY86O95711 162 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IFNA21P01568 189 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IL5P05113 134 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 Q8N1Y9 231 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 PALMDQ9NP74 551 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 UFC1Q9Y3C8 167 aa16.82■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 K7EMT4 169 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 MED6O75586 246 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-17P01599 117 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 NOXA1Q86UR1 476 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 TMEM116Q8NCL8 245 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 OR2K2Q8NGT1 345 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ENKURQ8TC29 256 aa16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 RELQ04864 619 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 CD69Q07108 199 aa16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 MARC2Q969Z3 335 aa16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 WRBO00258 174 aa16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 CCSO14618 274 aa16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A4P12235 298 aa16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 TOMM20LQ6UXN7 152 aa16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ZFAND3Q9H8U3 227 aa16.79■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 PRSS46E5RG02 174 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 IGLC1P0CG04 106 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 RND2P52198 227 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 PAX9P55771 341 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 LCN12Q6JVE5 192 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 DYNLRB2Q8TF09 96 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 C20orf24Q9BUV8 137 aa16.78■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 TIGITQ495A1 244 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ETFRF1Q6IPR1 90 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 BTNL8Q6UX41 500 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 ZNF600Q6ZNG1 722 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A13Q7RTY0 426 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 TMEM61Q8N0U2 210 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB3Q92617 1050 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 COL7A1Q02388 2944 aa16.77■□□□□ 0.28
SYF2-201ENST00000236273 YIF1AO95070 293 aa16.76■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 IFNA4P05014 189 aa16.76■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 SMPXQ9UHP9 88 aa16.76■□□□□ 0.27
SYF2-201ENST00000236273 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms