RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PN81 502 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PPI3 338 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 CHRNA7P36544 502 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 RND2P52198 227 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OR5T1Q8NG75 326 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ACY3Q96HD9 319 aa14.56□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 NDUFB4O95168 129 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 PNKDQ8N490 385 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 NECAP1Q8NC96 275 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.55□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 OVOL3O00110 214 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 TGOLN2O43493 480 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 PDE6DO43924 150 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 GOSR1O95249 250 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 APELAP0DMC3 54 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.54□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 IGHV4-39P01824 125 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 LGALS7P47929 136 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 PERPQ96FX8 193 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 LIPFP07098 398 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ARF6P62330 175 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 ZNF114Q8NC26 417 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 SLC35E1Q96K37 410 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 FAM210BQ96KR6 192 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 FUT9Q9Y231 359 aa14.53□□□□□ -0.08
USP18-201ENST00000215794 RBP4P02753 201 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 CRYGBP07316 175 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 PSG5Q15238 335 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TNXAQ16473 311 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 PRSS8Q16651 343 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 HCP5Q6MZN7 132 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 RPEQ96AT9 228 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.52□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TRGC2P03986 189 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 AREGP15514 252 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 LGALS4P56470 323 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TEX45Q8NA69 505 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 ZNF503Q96F45 646 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TIMD4Q96H15 378 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 F6UZH7 168 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 EFNA4P52798 201 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 LINC01551Q86U37 167 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 NPIPB3Q92617 1050 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.51□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 LY6LH3BQJ8 138 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 MFAP2P55001 183 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 NDUFA6P56556 154 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 KLRD1Q13241 179 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 MORN5Q5VZ52 161 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 SVIPQ8NHG7 77 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 H7BYZ3 331 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 ZNF90Q03938 601 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 MMD2Q8IY49 270 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 FBXL15Q9H469 300 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 DOK5Q9P104 306 aa14.5□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 ITPR2Q14571 2701 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 VENTXO95231 258 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 OR5G3P0C626 314 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 GALR1P47211 349 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 ATP5J2P56134 94 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 PYY3Q5JQD4 70 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.49□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa14.48□□□□□ -0.09
USP18-201ENST00000215794 PSMB11A5LHX3 300 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.3 ms