RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm14744B1AVU4 173 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vmn1r58G3X9U3 310 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ca11O70354 328 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P04219 140 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 LtaP09225 202 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TaglnP37804 201 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr504Q7TRU7 318 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2410137M14RikQ9CWF0 162 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 5430402E10RikQ9D3N5 173 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gpx8Q9D7B7 209 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rpl13a-ps1A0A140T8K2 203 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm7849D3YX03 116 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm21719J3KMI9 230 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cxcl1P12850 96 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 B4galt1P15535 399 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PvalbP32848 110 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prrx1P63013 245 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Q3U595 105 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 EnkurQ6SP97 255 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 ApoolQ78IK4 265 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr1212Q7TR08 311 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nanos1Q80WY3 267 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kiaa0513Q8R0A7 407 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pbp2Q8VIN1 187 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tsc22d4Q9EQN3 387 aa9.66□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm5286E0CXI6 357 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm7233E9PZI8 198 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr568E9Q554 313 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm9732F6QVC4 198 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm8104K7N744 198 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 F2rl2O08675 369 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kcns2O35174 477 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P01803 113 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CrpP14847 225 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Adgrg5Q3V3Z3 524 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4921517D22RikQ8CET0 269 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cmc2Q8K199 79 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 OtosQ8R448 89 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr539Q8VGL9 319 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cox4i2Q91W29 172 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 DapQ91XC8 102 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Polr3kQ9CQZ7 108 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Eaf1Q9D4C5 268 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ap1s2Q9DB50 160 aa9.65□□□□□ -0.86
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm13178B1AVU7 408 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm21915J3QPM7 133 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 DhodhO35435 395 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CntfrO88507 372 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 P04943 107 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rpl27aP14115 148 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rab7aP51150 207 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ndufb6Q3UIU2 128 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 March1Q6NZQ8 289 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tas2r116Q7M713 305 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Q8BG31 207 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam169bQ8CHT6 337 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PipoxQ9D826 390 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cldnd2Q9D9H2 167 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hacd1Q9QY80 281 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hnf4gQ9WUU6 408 aa9.65□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vmn1r204I7HIK1 302 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fcer1gP20491 86 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Il11P47873 199 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Vmn1r235Q8R297 328 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Arrdc1Q99KN1 434 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 GhsrQ99P50 364 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trappc2Q9CQP2 140 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 AmtnQ9D3J8 213 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ighv1-58A0A075B5W9 117 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gpr12P35412 334 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pate4Q09098 99 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm773Q3TML4 206 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Olfr452Q7TRV8 317 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Arfrp1Q8BXL7 201 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Inpp5kQ8C5L6 468 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slc24a3Q99PD7 645 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zcchc10Q9CX48 178 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prr15Q9D1T5 122 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rnf125Q9D9R0 233 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Spata25Q9DA57 226 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fbp1Q9QXD6 338 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trex2Q9R1A9 236 aa9.64□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TfpiO54819 306 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CfdP03953 259 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gsx1P31315 261 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Stfa1P35175 97 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hsf1P38532 525 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ube2e1P52482 193 aa9.63□□□□□ -0.87
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 S100a3P62818 101 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.6 ms