RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lyl1P27792 278 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Efnb1P52795 345 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q0VG62 139 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tbrg1Q3UB74 406 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Foxs1Q61574 329 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr275Q7TS18 319 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Harbi1Q8BR93 349 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mob3aQ8BSU7 217 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr860Q8VFF7 317 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr344Q8VFP9 309 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Xrcc3Q9CXE6 349 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 RhcgQ9QXP0 498 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slurp1Q9Z0K7 110 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 AcacaQ5SWU9 2345 aa6.06□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 TracA0A075B662 137 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Trbv12-1A0A0B4J1H0 124 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 A0A286YDM5 308 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem182B2RVY9 229 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr571E9Q407 322 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm17669F6QL70 154 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fgf12P61329 243 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rbp4Q00724 201 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc7a15Q50E62 488 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ppp1r3cQ7TMB3 317 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cstl1Q80Y72 140 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scrt2Q8BTH6 311 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vrk3Q8K3G5 453 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr490Q8VFD2 314 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Scgb3a2Q920H1 91 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Phf7Q9DAG9 307 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm29049A0A087WSM5 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm9602J3QPD5 205 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm21118J3QPK8 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tnfaip6O08859 275 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 St8sia2O35696 375 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cryba1P02525 198 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rpusd3Q14AI6 344 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smim15Q3UTD9 74 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20909Q5FWB5 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20852Q5M8R5 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20917Q62457 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20809Q62458 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20865Q62460 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf260Q62513 407 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Spred3Q6P6N5 408 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20738Q810R8 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 ArsjQ8BM89 598 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lmf2Q8C3X8 702 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hist3h2bbQ8CGP0 126 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1408Q8VG32 310 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1413Q8VGU3 323 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rcc1lQ9CYF5 461 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hist3h2baQ9D2U9 126 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20806Q9D9T3 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tceal6Q9DB24 200 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nat8Q9JIY7 227 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr154Q9QY00 318 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cldn34dA2AGU5 210 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 PtcraP0C6B2 199 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Wfdc8Q4KUS1 273 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 IslrQ6GU68 428 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 PnlipQ6P8U6 465 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 LgalslbQ7TPX9 165 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr874Q7TRE6 310 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mzt1Q8BUR9 78 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mansc1Q9CR33 414 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 P2ry6Q9ERK9 328 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cst10Q9JM84 148 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ncor1Q60974 2453 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ighv5-15A0A0A6YWC7 117 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tex45G3XA23 500 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mid1ip1Q9CQ20 182 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Rpp14Q9CQH8 122 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ndufa6Q9CQZ5 131 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 2610524H06RikQ9CZU9 139 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gng13Q9JMF3 67 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tex101Q9JMI7 250 aa6.05□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fcrl6A1YIY0 268 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem8bB1AWJ5 472 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm20821J3QPJ2 227 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Serf1O88892 62 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tcrg-V1P06325 135 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 HbzP06467 142 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 P18532 116 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gnb4P29387 340 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sftpa1P35242 248 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Efna2P52801 209 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Pla2g5P97391 137 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Shc1P98083 579 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 McptlQ00356 246 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prdx2Q61171 198 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr153Q7TR48 307 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem106bQ80X71 275 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Defb21Q8C5Z4 100 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc35e4Q8K3D6 351 aa6.04□□□□□ -1.44
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn1r36Q8R2E3 305 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.1 ms