RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616		Q9H3A6	140 aa		3.7	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF122	Q9H9V4	155 aa		3.7	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.7	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		3.7	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NCKAP5	O14513	1909 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM235	A6NFC5	223 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2A4	O95047	310 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CRH	P06850	196 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4E1	P0C645	316 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	FUT3	P21217	361 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPO	P30536	169 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF138	P52744	262 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PCBD1	P61457	104 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	QRFP	P83859	136 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A7A	Q86SG5	101 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NAA40	Q86UY6	237 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	S100A13	Q99584	98 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PRRT1	Q99946	306 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.69	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		H0Y9J4	135 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R135	149 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS3	O75911	302 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CST2	P09228	141 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CEACAM6	P40199	344 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GNG2	P59768	71 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	KISS1	Q15726	138 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MPPED2	Q15777	294 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX261	Q6UWH6	196 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5AS1	Q8N127	324 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10D3	Q8NH80	312 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PP6455	Q8WZ26	134 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CMBL	Q96DG6	245 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO17	Q96EF6	278 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF799	Q96GE5	643 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST6	Q9GZX3	395 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CST11	Q9H112	138 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		U3KQ87	197 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		V9GYS6	101 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNA1C	Q13936	2221 aa		3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MED12	Q93074	2177 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MPDZ	O75970	2070 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IFITM10	A6NMD0	228 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HMSD	A8MTL9	139 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616		F5H5P2	479 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC31A2	O15432	143 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	SOCS1	O15524	211 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	RP2	O75695	350 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA7	P01567	189 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-1	P01715	115 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	AMBP	P02760	352 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CSN2	P05814	226 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	CA7	P43166	264 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	OR3A4P	P47883	348 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ARPC4	P59998	168 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ESPL1	Q14674	2120 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	GUK1	Q16774	197 aa		3.67	□□□□□ -1.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82

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