RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631029.1

UBA3-213, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 5 BASIC

Gene UBA3, Length 123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-213	ENST00000631029	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	HCFC1	P51610	2035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029		H0YJW9	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF253	O75346	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CRYGC	P07315	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MYOD1	P15172	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF83	P51522	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	PRRX1	P54821	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SELENOV	P59797	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	LPAL2	Q16609	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	LTC4S	Q16873	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	RCHY1	Q96PM5	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBA3-213	ENST00000631029	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	C20orf202	A1L168	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	OVOL3	O00110	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	FCN3	O75636	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	CD33	P20138	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	HNF1A	P20823	631 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	PLP1	P60201	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	TBR1	Q16650	682 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	CT83	Q5H943	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029		A0A1W2PN81	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBA3-213	ENST00000631029	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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