RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.14□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FBXO24O75426 580 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CRYGCP07315 174 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CTRB1P17538 263 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC35E1Q96K37 410 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MED9Q9NWA0 146 aa7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FBN3Q75N90 2809 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SMCO3A2RU48 225 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LINC00862A6NCI5 91 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HAX1O00165 279 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AMY1AP04745 511 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 REG1AP05451 166 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM157CP0CG43 387 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MFAP2P55001 183 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SERF2P84101 59 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AKR1C1Q04828 323 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BTNL8Q6UX41 500 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TREML4Q6UXN2 200 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM219Q86XT9 240 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM68Q96MH6 324 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RSG1Q9BU20 258 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PARP11Q9NR21 331 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF580Q9UK33 172 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.12□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BTBD17A6NE02 478 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATP6V0E1O15342 81 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CYB5BO43169 146 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPRK1P41145 380 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IER3P46695 156 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KLK9Q2XQG4 91 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TEPPQ6URK8 271 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q6ZRG5 221 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF709Q8N972 641 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 THAP8Q8NA92 274 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MGST2Q99735 147 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM160Q9NX00 188 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.11□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATP6V1G1O75348 118 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHV4-59P01825 116 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MBP02144 154 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRH1P02810 166 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 APELAP0DMC3 54 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HNF1AP20823 631 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CAMLGP49069 296 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BLOC1S1P78537 153 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAB31Q13636 194 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LY6EQ16553 131 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q6YL49 198 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MISP3Q96FF7 219 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CXorf58Q96LI9 332 aa7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NUDT19A8MXV4 375 aa7.09□□□□□ -1.27
NUP50-AS1-203ENST00000609284 I3L2K1 104 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms